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INTRODUÇÃO: A implementação da Atenção Primária com as suas novas dinâmicas de assistência à saúde trouxe consigo novas questões éticas, relacionadas com a necessidade de uma nova postura dos profissionais e novas lógicas de trabalho. Na perspectiva de Gracia (2003), os problemas éticos são entendidos como situações onde são possíveis diversos cursos de solução, aplicando-se mais a realidade da Atenção Primária e diferenciando-se da realidade hospitalar, onde os dilemas são mais comuns e definem-se por possuírem dois caminhos opostos para soluçãoOBJETIVO: Interpretar dados de duas pesquisas qualitativas sobre problemas éticos percebidos pelos profissionais nos serviços de atenção primária de dois municípios da região metropolitana de Porto Alegre, RS.MÉTODOS: Os dados foram coletados em oito reuniões de discussão focal sobre os desafios éticos da prática dos profissionais em uma Estratégia Saúde da Família (ESF) de Campo Bom e uma Unidade Básica de Saúde (UBS) de São Leopoldo. O roteiro de discussão constou de aspectos da nova lógica da atenção primária e os seus problemas éticos emergentes. Os dados foram analisados na perspectiva da hermenêutica de profundidade para identificar os problemas éticos com atenção especial ao contexto e ao discurso dos profissionais.RESULTADOS: As falas dos profissionais apontaram para problemas éticos relativos à demanda, aos processos de trabalho e ao sistema de saúde. Também ficou claro que existem problemas éticos mais específicos da estratégia da saúde da família e outros mais próprios da unidade básica.CONCLUSÕES: Os problemas éticos identificados apontam questões importantes que interferem nas relações estabelecidas no ambiente de trabalho, seja com os demais profissionais, com os usuários ou com o próprio sistema de saúde. Tais conflitos podem comprometer a dinâmica de trabalho em sua resposta às necessidades de saúde.